作者：张艺心肌分化共表达网络聚类模块网络拓扑关键因子
摘要：目的:心脏疾病末期伴随着心肌细胞的大量缺失,心肌细胞直接重编程有助于心肌细胞再生,使心脏功能得以修复。要提高直接重编程的效率,需要更清楚心脏发育过程中相关转录因子的调控机制,发掘关键转录因子。方法:从NCBI的GEO下载心肌发育的单细胞转录组测序(scRNA-seq)数据GSE76118,对单细胞数据进行预处理后,利用加权基因共表达网络分析算法构建转录因子之间共表达网络,寻找与心肌分化相关的功能聚类模块,之后结合网络拓扑性特征参数筛选关键转录因子,从而组建更高效的转录因子组合,进行实验验证。结果:从共表达网络中发现与心肌相关的功能模块,根据网络拓扑性挖掘到关键的候选因子。结论:构建基因共表达网络的分析方法,有利于发掘关键功能模块、关键节点基因,是探索细胞命运机制的一个高效途径。
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