作者：相磊; 章振华; 胡国良; 陈小玲; 梁之昶; ...o型口蹄疫病毒系统发育树vp1基因
摘要：从GenBank和世界口蹄疫参考实验室基因库（WRLFMD）下载O型FMDV全VP1序列共210条，其中23条为已知基因型序列，其他为未知基因型序列。利用分子生物学软件DNAStar中的Clust—a1W和TreeView工具，以已知基因型的VP1区序列构建系统发育树，验证分型结果与已知基因型是否一致。然后以已知基因型序列作为参照，将未知基因型序列与已知基因型序列一起构建系统发育树，以已知基因型序列在系统发育树中所处的位置，来判断未知基因型序列的归属，从而明确它们归属于何种基因型。结果表明，采用此种分型方法获得Cathay型74条、SEA型24条、EA型4条、WA型4条、Euro-SA型21条、ME-SA型68条、ISA-1型3条、ISA-2型2条，未能分型序列10条。
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