作者：任文华; 张双全; 宋大祥; 周开亚cdna文库race少棘蜈蚣n基因序列分析毒腺构建快速扩增cdna末端smart技术blast软件全长cdnacdna克隆系统发生关系开放阅读框公共数据库氨基酸序列基因同源性双参数模型电泳检测mrna肌动蛋白基因片段
摘要：运用SMART技术首次构建了少棘蜈蚣(Scolopendra subspinipes)毒腺cDNA文库.经琼脂糖电泳检测,文库所含全长cDNA主要分布在500bp以上,大于2 000 bp的区域尚有很长拖尾,中间有几条高丰度mRNA亮带.以此文库为模板,通过5'RACE(Rapid amplification of cDNA ends,快速扩增cDNA末端)方法获得了细胞质肌动蛋白β-actin基因5'末端598 bp片段,其中包括开放阅读框546 bp,编码182个氨基酸.将该基因片段推导的氨基酸序列通过BLAST软件与蛋白质公共数据库Swissprot比对,发现与蜜蜂(Apis mellifera)的β-actin基因同源性高达96%,说明本实验所构文库质量完全可以满足用RACE方法进行功能基因的cDNA克隆.通过基于双参数模型的NJ法对部分动物β-actin基因进行系统重建,较好地反映了这些动物的系统发生关系.
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