作者：俞兆曦 连总强 吴旭东 杨忠礼 李力 张锋 ...myod基因克隆生物信息学
摘要：为研究兰州鲇（Silurus lanzhouensis）生长性状相关基因,运用RT-PCR、TA克隆和核酸测序等技术对兰州鲇MyoD基因的CDS区及全基因进行克隆和生物信息学分析。获得兰州鲇MyoD基因的完整CDS区序列810 bp（Gen Bank登录号：KT277551）及MyoD基因全序列1 210 bp（Gen Bank登录号：KT339175）,包括部分5＇端63 bp和3＇端58 bp;ORF区含有3个外显子和2个内含子,外显子长度分别为510 bp、80 bp和220 bp,内含子长度分别为156 bp和123 bp,编码269个氨基酸残基组成的可溶酸性蛋白质;预测亚细胞定位MyoD主要分布于细胞核（56.5%）,MyoD二聚体结构是一个螺旋-环-螺旋（b HLH）。基于12种鱼类MyoD基因CDS序列构建系统发育树及编码区同源性比较,分析结果表明,MyoD基因编码区在进化过程中比较保守,且兰州鲇MyoD与斑点叉尾、白鲶鱼、蓝鲶鱼之间存在较高的同源性。
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