作者：池玉杰; 李梦珠; 张健; 李晨语; 王泽慧偏肿革裥菌细胞色素p450染料降解基因差异表达
摘要：为了明确白腐真菌偏肿革裥菌(Lenzites gibbosa)降解双偶氮染料刚果红过程中细胞色素P450基因的功能,采用高通量测序技术对刚果红染料处理0、3、7、10h下的菌丝样本进行转录组测序,以比对到参考基因组上的每个基因的reads数即Count值作为表达量值,根据基因在对照组(0h)和染料处理组(3、7、10h)中表达量的变化,用DESeq_EBSeq软件进行样品组间的差异基因表达分析和差异基因筛选,对差异表达基因(DGEs)在eggNOG、GO和KEGG等数据库中进行功能注释与通路富集分析,对筛选出的相关差异基因在NCBI上进行DNA序列比对,并与相关参考文献进行比较分析。结果表明:在转录组所有的DGEs中,搜索出11个可能影响L.gibbosa降解刚果红过程的细胞色素P450基因,其中在CKvsGGH1(0vs3h)中未筛选出细胞色素P450差异基因,在CKvsGGH2(0vs7h)中筛选出3个差异基因,在CKvsGGH3(0vs10h)中筛选出8个差异基因,表明在L.gibbosa对刚果红染料脱色降解过程中细胞色素P450基因逐步参与了降解脱色过程。在10h时,被注释到木质素降解关键通路ko01220(芳香族化合物降解)中的gene_25488表现出差异表达。从11个细胞色素P450基因的差异表达中可以探究并揭示出一些潜在的生物学规律,最终结果表明L.gibbosa的细胞色素P450基因与双偶氮类染料刚果红的降解脱色有一定的关系。
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