作者:孙美涛; 王昀; 李月; 张晓娟; 杨勇琴; 杨...hmterf3生物信息学启动子区转录因子cpg岛
摘要:目的:探讨人线粒体转录终止因子3基因启动子区的序列特征、转录因子及其结合位点。方法:利用Promoter2.0、NNPP、Proscan、FirstEF软件分别预测hMTERF3基因5端上游的启动子数目及分布;利用CpGIslandSearcher和CpGPlot软件预测CpG岛位置;利用P-match1.0程序搜索TRANSFAC数据库预测与hMTERF3基因启动子结合的转录因子及其结合位点。结果:hMTERF3基因定位于8q21.2,基因全长22216bp,含有11个外显子和10个内含子。hMTERF3基因上游至5'侧翼共3000bp的核苷酸序列至少存在2个启动子区,其中1733~2302bp之间可能为包含TATA盒的核心启动子区。启动子区序列中存在1个长为1145bp的CpG岛。hMTERF3基因启动子区存在1055个转录因子结合位点,进化足迹法分析其保守的核心启动子区转录因子结合位点共19个。结论:hMTERF3基因启动子区的生物信息学分析能够提高基因启动子的研究效率,为后续实验构建hMTERF3基因启动子表达载体及鉴定启动子功能提供理论依据。
注:因版权方要求,不能公开全文,如需全文,请咨询杂志社