作者:郑轶琦; 王志勇; 郭海林; 薛丹丹; 刘建秀假俭草srap标记正交试验设计体系优化引物筛选
摘要:以假俭草叶片DNA为模板,采用正交试验设计,以Mg^2+、dNTP、引物和Taq DNA聚合酶4种因素3个水平,对假俭草SRAP反应体系进行研究,并比较了不同浓度模板DNA对扩增效果的影响,建立了假俭草的SRAP最佳反应体系。结果表明,假俭草SRAP—PCR最佳反应体系为:2μL10×PCR buffer、60ng模板DNA、Mg^2+ 1.50mmol/L、dNTP 260μmol/L、引物0.25μmol/L、Taq DNA聚合酶0.5U,总体积为20μL。各因素对扩增反应结果均有不同影响,其中以Mg^2+浓度影响最大,Taq DNA聚合酶的影响最小。运用该体系对4份假俭草种源进行验证,证明该体系稳定可靠,并从45个SRAP引物组合中筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的26个引物组合。这一体系的建立及多态性引物组合的筛选为今后利用SRAP标记技术进行假俭草分子遗传学研究提供了科学依据。
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