新疆生产建设兵团出版社于2007年5月经国家新闻出版总署批准成立，出版范围包括政治、经济、文化、科技、工程、教育、文艺等出版物，是一家综合性的出版社，也是兵团唯一的出版社。
新疆大学出版社是新疆维吾尔自治区惟一的一所大学出版社。新疆大学出版社立足新疆，面向中国，竭诚为新疆高等院校的教学和科研服务，重点编辑出版高校教材、教学参考书和学术著作等，同时积极出版反映新疆科研成果、具有新疆地区与民族特色和学科特点的专著及其他图书。
新疆教育出版社成立于1956年，是新疆以出版少数民族文字为主的教育综合出版社。全社现有职工204人，由维吾尔、汉、哈萨克、蒙古、柯尔克孜、回、俄罗斯、锡伯、乌孜别克、满等10个民族组成。下设24个科室和慧之源图书发行有限责任公司。用维吾尔文、汉文、哈萨克文、蒙古文、柯尔克孜文、锡伯文等六种文字出版各类学校教材、教师用书和教学类报、刊、图书。
伊犁人民出版社于1977年7月3日由伊犁哈萨克自治州党委批准成立。由于体制等多方面的原因，于1998年2月27日正式移交给自治区新闻出版局管理，人员编制定为60人。1998年出书191种。
新疆人民卫生出版社被自治区卫生厅确立为“新疆卫生系统有突出贡献单位”；70余种图书获省、自治区以上奖，曾获“中国出版政府·图书奖”，实现了社会效益和经济效益的最佳结合。
新疆科学技术出版社成立于1990年，地处新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市。经国家新闻出版总署批准，自2002年12月30日起改名为新疆科学技术出版社。
