作者：石生林; 张莹; 周敬林; 刘彦群; 秦利杆状病毒几丁质酶基因基因水平转移密码子使用模式
摘要：为阐明杆状病毒几丁质酶基因（v-Chi A）密码子使用在病毒基因组进化的基因水平转移中发生的适应性变化,比较分析了杆状病毒v-Chi A与昆虫几丁质酶基因（Chi-h）、沙雷氏菌几丁质酶基因（Chi A）以及杆状病毒以lef-8、lef-9和polh/gran基因为代表的基因组（表示为lef8-lef9-pg）的密码子使用模式。结果表明,杆状病毒v-Chi A与昆虫Chi-h的GC含量、GC3s含量、有效密码子数（ENc）及与沙雷氏菌Chi A的GC含量均无统计学差异（P〉0.05）;与杆状病毒lef8-lef9-pg的GC含量、GC3s含量、ENc值以及沙雷氏菌Chi A的GC3s含量、ENc值均有统计学差异（P〈0.05）。杆状病毒v-Chi A与lef8-lef9-pg、昆虫Chi-h和沙雷氏菌Chi A的同义密码子使用均高度相似（相似性系数分别为0.992、0.870、0.862）。选择与突变共同影响杆状病毒v-Chi A和lef8-lef9-pg的密码子使用,而昆虫Chi-h和沙雷氏菌Chi A的密码子使用完全由选择所影响。综上所述,杆状病毒v-Chi A的碱基组成及密码子偏好性与昆虫Chi-h相似,与lef8-lef9-pg不同;密码子使用的影响因素与lef8-lef9-pg相似,与昆虫Chi-h和沙雷氏菌Chi A不同。上述结果从密码子使用角度证实了杆状病毒v-Chi A来源于昆虫Chi-h的水平转移。
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