作者:李亚兰; 潘存德; 陈虹核桃热图多元回归树r语言
摘要:以新疆核桃主栽区收集的50份核桃种质资源为试材,采用序列相关扩增多态性(sequence-related amplified polymorphism,SRAP)标记技术分析其遗传多样性,以期为分布于新疆地区的核桃种质资源的保存、鉴定及综合开发利用提供参考依据。结果表明:从100对引物中筛选出16对扩增条带清晰、稳定性好的多态性SRAP引物组合,16对引物组合在50份供试种质中共扩增出178条带,多态性条带135条,多态位点百分率为75.84%。聚类分析及聚类锐度测试显示供试种质可分为10类,热图显示出不同引物对种质的区分情况,多元回归树显示不同引物中的26个扩增条带能够区分50份供试种质,其中M4/E4、M7/E5、M14/E4、M2/E11、M3/E4、M2/E4、M12/E13、M7/E1、M14/E13和M1/E3共10对引物组合是供试种质鉴定中重要的引物组合。同时R语言在统计分析中的应用,为今后核桃植物形态与遗传变异研究提供了新的数据分析方法。
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