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首页 期刊 北方园艺 致病疫霉基因组序列微卫星的发掘与开发分析【正文】

致病疫霉基因组序列微卫星的发掘与开发分析

作者:张宏磊 朱杰华 胡珍珠 杨志辉致病疫霉基因组微卫星

摘要:利用SciRoKo软件,确定了致病疫霉整个基因组及其不同区域完美型和复合型微卫星的数量,并分析其分布规律。结果表明:在致病疫霉基因组中共发现了5010个完美型微卫星位点,其出现频率平均为26.35个/Mb,最偏好基元类型为ACGG、AT和AAG;外显子区域仅含3~6个碱基的微卫星基元,其中3和6个碱基的微卫星基元占93.68%;复合型位点275个,82.18%为中断完美类型。通过SciRoKo软件对致病疫霉基因组不同区域的序列进行分析,共获得了430个适合开发高多态性微卫星标记位点,其中包括83个外显子编码区微卫星位点和264个非编码区位点;分别对32个编码区和105非编码区的微卫星位点进行验证,结果表明其开发成功率和多态性明显提高。

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北方园艺

《北方园艺》(半月刊)创刊于1977年,由黑龙江省农科院主管,黑龙江省农业科学院;黑龙江省园艺学会主办,CN刊号为:23-1247/S,自创刊以来,颇受业界和广大读者的关注和好评。 《北方园艺》园艺学专业刊物。主要刊登果树、 蔬菜、 瓜类、 花卉 、食用菌类等栽培方面的科研成果,普及生产知识,解答疑难问题。读者对象为园艺科技人员、大专院校师生及专业户。

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