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基于GBS技术的中华绒螯蟹的遗传特征分析

作者:高祥刚; 鲍相渤; 高美玲中华绒螯蟹gbssnp遗传多样性种群结构

摘要:[目的] 研究中华绒螯蟹经过多年的人工养殖、跨流域引种和增殖放流等活动可能会对其遗传特性造成的影响.[方法] 基于下 -代 GBS测序技术,利用 SNP标记对辽河家系、 辽河野生、长江群体、 海南群体、 黄河群体进行遗传特征分析.[结 果 ] 经过条件为测序 深度4x 、 Mi0.5、次要等位基因频率( MAF) 〉0.05的过滤后,共获得 652 7 4 6个高 质 量 的S N P 位点用于群体的遗传分析,各群体平均 观测杂合度( Ho)为 0.084 4 -0.14 9,平均期望杂合度( H e )为 0.097 4 - 0 . 2 0 3 ,群体平均n 值 ( P i)为 0. 158 3 ~0. 2 4 4 ,群 体 F i的平 均测量值( Fi)为 0.054 2 ~ 0.238 43.两两群体间遗传分化指数Fst值结合系统发生树,可以看出,长江群体与海南群体的遗传距离较 近,分化较小,表示海南的中华绒螯蟹苗种可能来自长江流域.[结论] 该研究揭示了不同水系中华绒螯蟹的遗传差异,探讨了其遗传 多样性水平,为中华绒鳌蟹资源的合理开发利用与保护提供理论依据.

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安徽农业科学

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