0
400-888-7501
首页 期刊 安徽农业科学 胡桃EST-SSR标记的筛选及引物设计【正文】

胡桃EST-SSR标记的筛选及引物设计

作者:冯怡 张智俊 张舍龙 罗淑萍胡桃微卫星引物

摘要:[目的]筛选胡桃的EST—SSR分子标记并对其进行引物设计。[方法]利用生物信息学方法对NCBI网上公开的5213条胡桃(Jug—lans regia Linn.)ESTs序列进行EST—SSR特征分析,利用Primer3.0软件对筛选出的EST序列设计引物。[结果]在ESTs序列中共检索出207个SSR,其中无冗余序列188,检出率为3.97%,平均分布距离为21.12kb,包括92种重复基元,其中以二核苷酸和三核苷酸重复类型为主,分别占总数目的31.40%和35.27%;对随机筛选出的50条SSR引物进行PCR扩增验证,初步筛选出30对引物。[结论]通过对胡桃EST序列中SSR位点的发掘分析,有针对性地设计EST.SSR引物,将为胡桃科EST—SSR分子标记的开发奠定基础。

注:因版权方要求,不能公开全文,如需全文,请咨询杂志社

安徽农业科学

《安徽农业科学》(CN:34-1076/S)是一本有较高学术价值的大型半月刊,自创刊以来,选题新奇而不失报道广度,服务大众而不失理论高度。颇受业界和广大读者的关注和好评。 《安徽农业科学》综合性农业学术期刊,主要刊登全国范围的农、林、牧、副、渔业基础理论、应用研究及农业经济研究、农史研究等与农业有关的学术研究论文,追踪报道各学科的新实用的农业科技成果。

杂志详情