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四球茶转录组SSR位点信息分析

作者:黎瑞源; 邢辉; 申铁四球茶转录组ssr

摘要:对基于高通量测序拼接获得的99741条四球茶嫩叶Unigenes进行了SSR(simplesequencerepeats)位点分析,共揭示了23732个SSR位点,分布于18552条Unigenes中,SSR发生频率为23.79%:含有SSR住点的Unigenes的总长度为226188bp,SSR位点间的平均距离为1/2.07kb,重复长度平均长度为9.53bp。在四球茶转录组SSR中,二核苷酸重复和三核苷酸重复是主要的重复类型,分别占总SSRs的47.53%和25.92%:在181种重复基元类型中,优势重复基元分别是AG/CT、A/T、ACC/GGT,分别占总SSRs的41.38%、22.10%和6.49%,共占总SSRs的比例达69.97%。

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安徽农业大学学报

《安徽农业大学学报》(CN:34-1162/S)是一本有较高学术价值的大型双月刊,自创刊以来,选题新奇而不失报道广度,服务大众而不失理论高度。颇受业界和广大读者的关注和好评。 《安徽农业大学学报》一贯坚持正确的办刊方针,认真贯彻中国共产党的基本路线,全面贯彻中国有关科学技术和出版的政策法令,认真执行“百花齐放,百家争鸣”和“科学技术工作必须面向经济建设”的方针。

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