作者:葛亚俊; 格鹏飞; 席进孝; 李伟; 张宏; 马...耶尔森菌鼠疫生态型基因分型
摘要:目的 对甘肃省鼠疫菌株进行基因分型,分析不同生态型鼠疫菌株在不同行政地区、不同时间的流行趋势。方法 运用规律成簇的间隔短回文重复序列(CRISPR)对甘肃省甘宁黄鼠型(9株)、阿尔金型(18株)、祁连型(45株)及青藏型鼠疫菌株(121株)进行分型及遗传进化关系分析,分型按国际通用标准命名。并探讨甘肃省不同行政地区和不同流行时间CRISPR基因分型的变化情况。结果 甘肃省鼠疫菌株被分为2个CRISPR基因簇(Ca7和Cb4),4个基因型(7、22、24及26型)。从来源地看,阿克塞、肃北、玉门、肃南均以24型[36.36%(16/44)、36.17%(17/47)、50.00%(5/10)、38.67%(29/75)]为主基因型,夏河、会宁均以26型(4/7)为主基因型,山丹以22型(1/1)为主基因型。从时间上看,甘肃省1960 - 1969、1970 - 1979、1980 - 1989年鼠疫菌均以26型[53.33%(8/15)、60.00%(6/10)、48.28%(14/29)]为主基因型,1990 - 1999年以22型[40.91%(18/44)]为主基因型,2000 - 2009年以24型[43.16%(41/95)]为主基因型。结论 甘肃省鼠疫菌基因型在不同行政地区、不同时间流行趋势不同。
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