作者：白优; 张勇; 陈祥; 张雄; 李俊; 何琦; 杨...从江香猪mef2d基因snp启动子生物信息学
摘要：研究以从江香猪、杜×长×大外三元杂交猪及贵州宗地花猪为研究对象,采用混合DNA池结合直接测序技术筛选猪MEF2D基因5＇UTR及第1外显子区SNPs位点;同时利用生物信息学软件分析SNPs位点对核心启动子区、Cp G岛和转录因子结合位点的影响。结果表明：在猪MEF2D基因5＇UTR区共筛查到4个SNPs位点,分别为A-511G、T-453A、T-242G和T-180A;生物信息学软件预测发现T-453A和T-242G位点附近有重要转录因子结合位点消失和新位点生成,据此推测猪MEF2D基因5＇UTR区的T-453A和T-242G位点对调控启动子功能元件可能存在重要影响。
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