作者：陈希文; 李莲; 尹苗; 赖守勋; 汪谦; 罗文...orf5遗传变异序列分析
摘要：为了监测猪繁殖与呼吸综合征病毒（porcinereproductiveandrespiratorysyndromevirus，PRRSV）流行毒株的基因变异情况，对四川省2014—2015年蓝耳病发病猪场分离到的6株PRRSV毒株ORF5基因进行了克隆测序及序列分析。同源性分析表明，6株PRRSV分离株ORF5基因核苷酸（氨基酸）与VR2332株的同源性为88．9％～89．4％（86．5％～88．7％），与CH—1a株同源性为93．7％～94．7％（90％～92％），与jxAt株同源性为97．2％～98．5％（95％～97％），与美国新出现的变异株NADC30同源性为85．90,4～86．7％（85．5％～87．5％），与欧洲型代表株Lelystadvirus同源性为62．7％～63．7％（56．5％～57．5％）。遗传进化树分析表明，6株PRRSV与jxAl、HuN4等高致病毒株亲缘关系近，并位于同一分支。氨基酸序列分析表明，6株PRRSVORF5基因编码氨基酸在PRRSV毒力相关住点aa13、aa151和区分野毒与疫苗毒的位点aa137均与JXAl、HUN4等强毒株相同，表明6个分离株均为较强的野毒株。在中和表位（aa37～aa45）和非中和表位（aa27～aa30，aa180～aa197）等区域与国内外参考毒株vR2332、CH-1a、JXAl、HUN4、NADC30、HENAN—XINX、JL580等相比，也出现了不同程度的变异。抗原性分析结果表明，6株PRRSVORF5基因编码产物的抗原表位主要位于aa30～aa39，aa50～aa60，aa128～aa132，aa136～aa141，aa146～aa155，aa161～aa183，aa191～aa200，与jxAl具有相似的抗原性特征，而与VR2332差异较大，主要表现在aa30～aa39相较于vR2332株抗原区域明显变窄。而在6个分离株中，SN9的抗原表位明显低于其他任何毒株。本研究结果表明，四川省PRRSV流行毒株仍然为JXA1变异株，但在当前高频度活疫苗免疫下，其基因的变异和抗原表住的改变在加剧，需加强对PRRSV基因变异的监控。
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