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基于高通量测序进行无创产前亲子鉴定的可行性

作者:蒋浩君; 穆豪放; 尹路; 陈芳; 杜舟; 何农...法医物证学高通量测序短串联重读序列无创产前亲子鉴定

摘要:目的初步探讨基于高通量测序进行STR分型的技术方法应用于无创产前亲子鉴定的可行性。方法选择13个STR基因座(6个常染色体STR基因座,6个Y染色体STR基因座,1个性别判定基因座),进行复合PCR扩增和高通量测序文库构建后,采用Ion PGM400高通量测序平台进行测序,并采用自主研发软件NGS.STRgenotyper(perl脚本)进行STR分型,本文简称上述过程为NGS-STR分型。对13个母子配对混合样本(母亲儿子=2%~50%)、1组家系样本进行了上述NGS.STR分型,旨在(1)了解其在混合样本中的灵敏度及分型情况;(2)了解其在无创产前亲子鉴定中的应用可能性。结果 (1)当混合样本中低组分(儿子)的比例超过8%,所有基因座均可检出低组分的STR信息; (2)对1例血浆样本进行NGS.STR分型,共计69.2%的基因座可检出胎儿的STR基因型信息,且所有检出基因座均符合孟德尔遗传规律。结论初步证明了NGS.STR分型技术具有进行无创产前亲子鉴定的可行性。

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