作者：原晓龙; 赵能; 陈剑; 王娟; 杨宇明;哈茨木霉基因组发掘nrps基因多样性生物信息学分析
摘要：为了解哈茨木霉中非核糖体肽的生物合成，本文通过本地BLAST、结构域分析结合抗生素和次生代谢产物分析软件（antiSMASH）、天然产物结构域查找软件（NaPDoS）等次生代谢产物生物合成基因分析工具对哈茨木霉基因组中的非核糖体肽合成酶NRPS基因进行分析，通过本地BLAST获得42个可能具有NRPS基因的重叠群（contig），开放阅读框及结构域分析显示具A-T-C（A为腺苷酰化结构域、T为肽酰基载体蛋白结构域，又称为PCP结构域、C为缩合结构域）3个结构域的蛋白序列有21条；antiSMASH分析结果显示其基因组中合成NRPs的基因簇有10个；NaPDoS和聚类分析结果表明哈茨木霉中的NRPS基因催化合成的NRPs包括铁载体类、毒素类、抗生素类及一些未知化合物。
注：因版权方要求，不能公开全文，如需全文，请咨询杂志社
