作者：李光华; 郑勇; 史贵军; 方春晓; 程丽云; ...食管鳞癌长链非编码rna信使rna靶基因预测
摘要：目的：全基因组关联分析食管癌组织中长链非编码RNA（1ncRNA）表达水平的改变及其意义。方法：通过基因芯片技术筛选了6对食管癌及其癌旁正常组织中差异表达的IncRNA和mRNA，通过靶基因预测，利用基因本体论（GO）和Pathway进一步分析lncRNA的功能。结果：差异表达（2倍以上变化且P〈0．05）1ncRNA共680个，其中161个IncRNA表达上调，519个lncRNA表达下调；差异表达mRNA共1472个，其中653个mRNA上调，819个mRNA下调。GO和通路分析表明这些差异表达基因参与11条可能与食管鳞癌相关的通路，包括翻译后蛋白修饰调节，粘蛋白0型聚糖的生物合成和鞘糖脂代谢途径等通路，主要涉及分子功能、细胞成分和生物过程的改变。通过顺式和反式调控分析发现共有11个lncRNA有cis-调控的靶基因，1个IncRNA有trans．调控的靶基因，3个lncRNA同时有cis-和trans-调控的靶基因。结论：与癌旁正常组织相比，新疆汉族食管癌组织中IncRNA的表达水平明显改变，差异表达的lncRNA可能通过某些信号通路参与食管癌的发生发展，对进一步寻找食管鳞癌诊断和治疗相关的新的靶点具有重要意义。
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