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蒙古冰草苗期抗旱相关microRNA的差异表达分析及靶基因预测

作者:马艳红; 张旭婷; 于肖夏; 刘旭婷; 高慧; ...蒙古冰草干旱胁迫microrna靶基因预测

摘要:为明确蒙古冰草抗旱相关microRNA(miRNA)的表达特征及其靶基因,利用实时荧光定量PCR技术,对前期测序筛选到的4个miRNA(amo-miR21、amo-miR44、amo-miR62、amo-miR82)在干旱胁迫下的苗期差异表达情况进行了定量验证,用TargetFinder软件和psRNATarget数据库在线预测其靶基因,并用MegAlign软件对预测的靶基因进行了同源性比对分析。结果表明,干旱胁迫下,蒙古冰草中amo-miR21、amo-miR82和amo-miR62的表达量呈上调趋势,而amo-miR44的表达呈下调趋势,与前期测序结果相符;4个miRNA共预测出32个靶基因,其中,amo-miR44在玉米、水稻和小麦数据库中未发现同源的靶基因,在拟南芥、大麦、蒺藜苜蓿中发现的靶基因相似性较低;而amo-miR21、amo-miR82和amo-miR62的靶基因均与小麦中预测的靶基因存在较高同源性(68.6%-95.6%),推测这3个靶基因是参与干旱逆境胁迫响应的基因。

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麦类作物学报

《麦类作物学报》(CN:61-1359/S)是一本有较高学术价值的大型月刊,自创刊以来,选题新奇而不失报道广度,服务大众而不失理论高度。颇受业界和广大读者的关注和好评。 《麦类作物学报》主要刊登麦类作物(小麦、大麦、燕麦、黑麦等)遗传育种、生理生化、栽培管理、食品加工、产品贸易等方面的学术性研究论文。读者对象为国内外农业科技人员、农业院校师生及高级农业技术推广和管理人员。本刊为国家科技部“中国科技优秀期刊”、《中文优秀期刊要目总览》“农作物类优秀期刊”、《中国知识资源总库》 “中国科技精品期刊”。

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