作者：武家琦; 胡朔枫; 张健; 袁寒玉; 石强; 应...乳腺肿瘤新辅助化疗化疗疗效差异基因表达氟尿嘧啶多柔比星环磷酰胺
摘要：目的分析乳腺癌新辅助化疗前活检组织的基因表达谱数据,筛选与T/FAC（多西他赛、氟尿嘧啶、多柔比星和环磷酰胺）或T/FEC（多西他赛、氟尿嘧啶、表柔比星和环磷酰胺）新辅助化疗方案治疗有效性显著相关的基因。方法从国际上已发表的相关文献中检索并获取乳腺癌基因表达谱数据,按照统一的新辅助化疗方式进行数据筛选,最终保留4个符合要求的数据集,共844个样本。其中样本按照化疗效果分为病理完全缓解（p CR）和残留浸润性癌（RD）两类。分析两组样本差异表达的基因,探讨其表达水平的变化与化疗疗效的相关性。结果通过分析,我们分别在4个数据集中找出显著差异的基因（校正P〈0.05）,按照表达水平的高低,分为p CR组相比RD组高表达的基因和低表达的基因两组。最后,将4个数据的结果整合,得到在4个数据集中同时高表达或低表达的基因,分别为34和42个。基于交集的差异表达基因,对样本进行无监督聚类,发现p CR和RD两组倾向性地分别富集在两类（一致性检验,P〈0.05）。结论分析得到的76个差异表达基因与乳腺癌新辅助化疗疗效有关,可能成为新的化疗疗效预测标志物。
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