作者：吴娟子; 钱晨; 张建丽; 刘智微; 钟小仙; ...象草基因克隆生物信息学分析
摘要：从象草中克隆了CpCCoAOMT2基因，并对其进行了初步的生物信息学分析。利用转录组测序获得的表达序列信息，设计1对特异性的PCR引物，应用RT—PCR技术从象草中扩增出CpCCoAOMT2基因。对获得的基因进行序列同源性搜索、结构域搜索及3D结构预测、分子系统进化树构建等生物信息学分析。测序结果表明，CCoAOMT2基因全长926bp，含110bp的5’-UTR、741bp的CDS和75bp的3’-UTR，共编码246个氨基酸，GenBank登录号为Bankh1975804；Blastn和BlastT分析结果显示，劬CCoAOMT2基因及其编码的蛋白在核苷酸水平和氨基酸水平上与多种植物的CCoAOMT基因和CCoAOMT蛋白具同源性；预测CpCCoAOMT2蛋白相对分子质量为27253，等电点为5，08，是一个不含跨膜结构域、不含信号肽分子的亲水性、稳定蛋白。分子进化树分析结果表明，CpCCoAOMT2蛋白与禾本科植物的CCoAOMT蛋白亲缘关系最近，与裸子植物和蕨类植物关系较近，而与双子叶植物的关系较远。
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