作者：周传江; 伍振兴; 顾钱洪; 孟晓林; 聂国兴coi基因虾虎鱼种间遗传距离种内遗传距离
摘要：虾虎鱼是鲈形目一类常见鱼类,广泛分布在我国各个水系,本文以线粒体细胞色素C亚基I(COI)DNA序列为分子标记,通过研究豫北四个采样点虾虎鱼DNA条形码来揭示物种多样性及分子系统发育关系,从而全面了解我省虾虎鱼遗传多样性现状。采用苯酚/氯仿抽提法提取虾虎鱼的基因组,凝胶电泳检测提取效果,采用常用的鱼类COI基因扩增引物扩增目的片段,商业公司送样测序获得其DNA条形码序列。研究共获得2种虾虎鱼(子陵吻虾虎Rhinogobius giurinus和褐吻虾虎Rhinogobius Brunneus)共39条序列,MEGA5.0软件分析结果表明:第三密码子G含量最低,COI基因各位点平均A+T含量要高于G+C含量。以臀斑颌鳞虾虎鱼(Gnatholepis anjerensis)为外类群,本研究涉及的两个物种分别聚成高支持率的单系类群。两种虾虎鱼种间平均遗传距离是0.19,种内平均遗传距离为0.0037,种间平均遗传距离是种内平均遗传距离的54倍,说明采用COI作为分子标记能识别出豫北虾虎鱼物种,为有效的分子标记,同时系统发育分析显示COI可作为分子标记建立虾虎鱼科的系统发育关系。
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