作者:李智丽; 黄淑坚; 马静云; 毕英佐猪流行性腹泻病毒动态监控s基因遗传变异
摘要:应用RT-PCR方法对南方地区五省(广东、广西、福建、四川、江苏)18个猪场7日龄以内发病仔猪的小肠组织和粪便样本进行猪流行性腹泻病毒(PEDV)检测,对9个猪场进行为期5年的动态监控,并对2011-2015年期间分离的35个PEDV流行株的s基因进行测序,与GenBank中的PEDV参考序列进行比较,并绘制了系统进化树。结果显示,上述地区五省存在Groupl和Group2两种类型毒株。Groupl与美国、韩国毒株较为接近,可分为G1-1、G1-2、G1-3和G1-4等4个亚群,Group2与2004年国内分离毒株较为接近,可分为G2-1、G2-2两个亚群。25个中国南方地区毒株集中于G1-2和G1-3,而另外8株与2004年国内毒株(JS-2004-2)同属G2—2亚群。不同类型的毒株引发的PEDV临床表现及死亡率不同,G2-2亚群的毒株引发的PED相对缓和,死亡率较低且病程较短,而位于G1-2和G1-3亚群(尤其是G1-3)的毒株则引起大规模急性暴发,病程较长,死亡率较高。
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